Aide:Autoformation/Module 2

Le deuxième module de l'autoformation permet un survol de l'ontologie de Wikimedica et indique comment ajouter des éléments complexes aux pages comme des modèles ou des algorithmes.

À quelle classe appartient ma page ?

Page principale: Gestion:Ontologie

Les pages sur le wiki sont construites selon des modèles spécifiques.

À titre d'exemple, toutes les pages de maladies ont la même structure ; toutes les pages de médicaments ont la même structure. Et ainsi de suite !

Voici les différents types de page sur le wiki.

Si vous désirez explorer toutes les pages d'une classe, visitez la page Recherche par thématique.

Pour être certain du bon modèle de page à utiliser pour la création de votre page, il est recommandé de discuter avec un rédacteur en chef avant la création du brouillon. Le choix du mauvais type de page au début du processus peut causer beaucoup de travail s'il est modifié tardivement.

Dans la grande majorité des cas, vous n'aurez pas à trouver le type de page, car l'éditeur en chef responsable de la publication de votre page aura déjà sélectionné le bon type de page avant que vous ne commenciez à écrire.

Comment différencier les types de page ?

Bien que cette tâche appartienne aux rédacteurs en chef, il est quand même intéressant de comprendre ce qui sous-tend le choix du type de page.

Cela permet d'avoir un point de vue un peu plus global du wiki que simplement sa propre page.


Type	Exemple	Description
Maladie	Asthme	Les maladies, c'est la base dans le domaine de la santé. Les maladies sont nombreuses et fort intuitives : asthme, migraine, otite moyenne aiguë, sinusite, bursite trochantérienne, etc.
Classe de maladie	Syndrome coronarien aigu	C'est la même chose que la maladie, mais on retrouve également la section Classification en position numéro 4, entre Étiologies et Physiopathologie. Cette section sert à lister les pathologies qui sont « membres » de cette classe. Par exemple, pour la classe de maladie Syndrome coronarien aigu, on y retrouverait : l'angine instable le STEMI le NSTEMI.
Approche clinique	Dyspnée (approche clinique)	Qu'est-ce que sont les approches cliniques ? Habituellement, c'est ce qui se retrouve dans la raison de consultation du patient dans une note médicale ou dans la note de l'infirmière au triage : ce sont des signes, des symptômes ou des signes paracliniques. C'est l'approche du clinicien face à cette problématique. En voici des exemples : l'épistaxis le trouble d'élocution l'ictère chez le nouveau-né l'hémorragie digestive basse la dyspnée aiguë la douleur thoracique la fièvre d'étiologie indéterminée chez l'enfant 0-3 mois la fièvre en retour de voyage la douleur abdominale aiguë la diarrhée chronique. Vous remarquerez qu'aucun des éléments précédents sont des diagnostics précis : ce sont des présentations cliniques que peuvent avoir plusieurs maladies. Parfois, il est difficile de tracer la ligne entre la classe de maladie et l'approche clinique. Vous y parviendrez avec le temps et il est parfois nécessaire d'avoir une discussion entre collègues pour y arriver. Voici quelques exemples supplémentaires qui permettent de voir la dualité entre l'approche clinique et la classe de maladie. La douleur à l'épaule est une approche clinique alors que la tendinopathie de la coiffe des rotateurs est une classe de maladie. La polyarthralgie est une approche clinique alors que l'arthrite inflammatoire est une classe de maladie. La douleur thoracique aiguë est une approche clinique alors que le syndrome coronarien aiguë est une classe de maladie. C'est important de différencier l'approche clinique de la classe de maladie, car la structure de la page est différente (et les données sémantiques aussi). Si la page que vous désirez faire n'existe pas sur Wikimedica, nous importerons une page avec la bonne structure. Si la page est déjà sur le wiki, il est probable que la structure soit déjà la bonne.
Concept	Enzyme Consentement	Le concept est à la base de tous les types de pages. Il est utilisé pour les pages de contenu qui ne répondent pas à un autre type ontologique plus précis.
Symptôme Signe clinique Signe paraclinique	Dyspnée (symptôme) Signe du psoas (signe clinique) Leucocytose (signe paraclinique)	Ces trois types de page servent à définir les signes et symptômes et à accueillir des données sémantiques et à décrire la technique pour obtenir ces paramètres. Vous remarquerez qu'il existe Dyspnée (symptôme) et Dyspnée (approche clinique), la raison étant que certaines pages d'approche clinique s'appliquent à plusieurs signes/symptômes ou que certains symptômes/signes ont plusieurs approches cliniques. Par exemple, plutôt que de constamment réécrire sur toutes les pages en lien avec les maladies biliaires ce qu'est le signe de McBurney, on crée une page pour décrire la manoeuvre appropriée et le diagnostic différentiel de ce signe. C'est le même principe pour les symptômes : on crée une page sur la dyspnée, une définition commune est offerte, le diagnostic différentiel y apparait puis on indique comment on questionne ce symptôme.
Examen clinique Examen paraclinique	Examen cardiaque Analyse d'urine	Dans ces pages, on y décrit des examens cliniques (qu'un clinicien fait au chevet de son patient) ou des examens paracliniques (laboratoires ou imagerie). Les examens permettent de mettre en évidence des signes.
Outil clinique Règle de décision clinique Critères diagnostiques Classification clinique	Critères d'Ottawa pour le genou Critères de Duke NYHA (classe fonctionnelle)	Ces pages servent à accueillir le Score de Wells, les Critères de Rome, les Critères DSM, l'échelle NYHA de la dyspnée, etc.
Procédure	Appendicectomie	On y décrit comment faire des procédures chirurgicales et non chirurgicales, les indications, les contre-indications, les complications, etc. L'appendicectomie, le drain thoracique et le tube naso-gastrique sont des exemples de pages de procédure.
Médicament Classe de médicament	Metformine Benzodiazépines	Ces pages remplissent le rôle des monographies du fabriquant, mais elles sont structurées pour être beaucoup plus facile à consulter en clinique et s'articulent avec toute l'infrastructure sémantique de la plateforme.
Pathogène		On y décrit le pathogène lui-même (ex. Clostridium difficile), et non la maladie qu'il cause (ex. Colite à C. Difficile). Comment l'identifie-t-on ? Gram positif ou négatif ? Virus/parasite/bactérie ? Quels sont ses mécanismes de résistance ? Etc.

Que dois-je mettre dans chacune des sections de la page ?

Chaque classe définit des sections obligatoires et facultatives. Ces sections sont identifiées dans le gabarit par des bannières oranges et bleues. Un texte décrit également ce que doit contenir la section.

Si un rédacteur en chef vous a attribué une page, des bannières bleues et oranges sont présentes dans chacune des sections de votre brouillon.

Allez voir le prototype de la page maladie pour bien comprendre : Classe:Maladie/Prototype.

Lisez bien ces bannières ! Elles vous indiqueront :

une description de la section
le formatage à utiliser dans cette section: texte, liste ou tableau
une section obligatoire ou facultative :
- bleu = facultative (à noter que si une section est facultative, mais qu'elle est pertinente pour cette page, il est important de la compléter)
- orange = obligatoire
les balises sémantiques à ajouter dans la section
les pièges à éviter dans la section Commentaires
un exemple de ce qui est attendu pour cette section.

Une fois votre travail complété, vous pourrez supprimer ces bannières.

Sections obligatoires

Les sections obligatoires sont marquées par les bannières oranges.

Ces sections doivent être remplies pour qu'un article soit publié.

La section obligatoire Présentation clinique ne contient pour le moment aucune information.
Toute contribution serait appréciée.

Description:	Cette section contient la sous-section optionnelle Facteurs de risque et les sous-sections obligatoires Questionnaire et Examen clinique.
Formats:	Texte
Balises sémantiques:
Commentaires:	La section Présentation clinique ne sert qu'à accueillir ces trois sous-sections : aucune information ne doit se retrouver entre le titre de section Présentation clinique et les autres sous-titres. Ce sont les sous-sections qui doivent être détaillées. Une erreur fréquente est de laisser les facteurs de risque, le questionnaire et l'examen physique en un ou des paragraphes dans la section Présentation clinique, mais de ne pas détailler les sous-sections Facteurs de risque, Questionnaire et Examen clinique.
Exemple:	Présentation clinique (Aucun texte) Facteurs de risque (Texte) Questionnaire (Texte) Examen clinique (Texte)

Sections facultatives

Les sections facultatives sont marquées par des bannières bleues. Si une section facultative n'est pas nécessaire, elle peut être supprimée.

Ces sections ne sont pas obligatoires pour publier la page. Si certaines sections facultatives sont vides et sont jugées inutiles, vous pouvez les supprimer.

La section facultative Suivi ne contient pour le moment aucune information.
Si la section est n'est pas jugée nécessaire, elle peut être supprimée.

Description:	Cette section traite du suivi de la maladie.
Formats:	Texte
Balises sémantiques:
Commentaires:	Est-ce que la patient aura besoin d'être revu dans X semaines ? Quels doivent être les consignes données au patient ? Cette section peut également traiter du suivi intrahospitalier. Quels sont les éléments cliniques (signes/symptômes) et paracliniques (imagerie et laboratoire) à répéter ? À quelle fréquence ? Pour quelle raison ?
Exemple:

Sections discrétionnaires

En plus des sections obligatoires et facultatives, il est parfois nécessaire d'ajouter des sections non définies. Il pourrait s'agir d'une section sur l'anatomie, sur un score clinique, sur une classification clinique, etc.

Les sections discrétionnaires sont permises sur le wiki. Elles s'ajoutent à la structure existante, mais ne s'y substitue pas.

La classe définit seulement les sections obligatoires et facultatives. Des sections supplémentaires peuvent être ajoutées à la discrétion de l'éditeur si elles sont nécessaires.

Modèles

Page principale: Aide:Modèles

Sur Wikimedica, il y a le texte, les liens, les tableaux, les images et les modèles. Les modèles, c'est ce qui distingue Wikimedica d'un PDF.

Les modèles sont accessibles depuis Insérer -> Modèle dans l'interface. Tapez son nom, donnez-lui les paramètres voulus et le tour est joué.

Les encadrés ? Modèle:Boîte
Les bannières de section plus haut ? Modèle:Section ontologique
Vous avez compris le principe.

Il y en a des centaines... Rappelez-vous simplement que si un modèle vous intéresse et que vous ne connaissez pas son nom, vous n'avez qu'à le copier-coller depuis une autre page sur lequel il est affiché.

Qu'est-ce qu'une boîte d'information ?

Les boîtes d'information sont des modèles qui sont présents dans chaque page de contenu. Chaque classe possède sa boîte d'information spécifique. Par exemple, la boîte d'information de la classe Maladie est différente de celle de la classe Signe clinique. Les utilités de la boîte d'information sont multiples :

offrir au lecteur un résumé rapide de la page
définir plusieurs données sémantiques de la page, telles que les spécialités, la classe de page, les noms alternatifs, etc.
classer automatiquement les pages en fonction de différentes catégories.

La vidéo suivante explique comment modifier la boîte d'information.

Vous êtes encouragés à remplir les champs à l'intérieur de la boîte d'information.

Comment insérer des données sémantiques ?

Page principale: Aide:Balises et données sémantiques

Chaque page de Wikimedica a deux versions. Pour la pré-éclampsie, voici les deux versions :

Ce que vous avez vu dans la version pour les ordinateurs, ce sont les données sémantiques.

Les données sémantiques, ce sont des mots dans le texte auxquels on ajoute des propriétés. Par exemple, en ajoutant des petits modèles à travers le texte, il est possible de définir que le tabagisme est un facteur de risque de syndrome coronarien aigu, que la dyspnée est un symptôme de la pneumonie et que la douleur abdominale à la fosse iliaque droite est un signe d'appendicite.

Pour un article, l'importance des données sémantiques est limitée, mais lorsqu'on les accumule, c'est là où ça peut devenir intéressant. Comment ? Les intelligences artificielles et les systèmes experts adorent les données sémantiques.

Avant de pouvoir bénéficier de ces technologies futuristes, il faut d'abord enrichir le texte de données sémantiques grâce à des modèles tout simples.

Et comment une donnée sémantique est-elle ajoutée? Par un modèle! C'est vraiment simple à faire. Visionnez la vidéo suivante pour apprendre à insérer des données sémantiques.

Vous vous souvenez des bannières ? Les bannières bleues et oranges vous indiqueront le nom des modèles à ajouter dans chaque section. Par exemple, le modèle Étiologie doit être ajouté dans la section Étiologie.

Modèle Flowchart

Page principale: Aide:Diagramme

Ce modèle vous permet d'insérer de jolis algorithmes comme celui-ci.

Pour apprendre à les insérer, ça demande un peu d'entrainement. Voir la page d'aide sur le modèle Flowchart.

Vous n'avez pas besoin d'apprendre à faire des diagrammes tout de suite : vous avez seulement besoin de savoir que ça existe.

Comment ajouter l'élément X à ma page?

Rappelez-vous également que si vous croisez sur une autre page un élément qui vous intéresse et que vous voulez l'ajouter à votre propre page.

Passez en mode édition dans la page où se trouve l'élément qui vous intéresse.
Copiez cet élément.
Collez-le dans votre page.

Convertir les sources

Cette étape prend littéralement deux minutes. Lorsqu'on importe une page par l'outil d'importation, les références sont parfois présentées sous forme de lien URL plutôt que sous la forme d'une référence bibliographique standard. La vidéo ci-dessous vous enseignera comment procéder.

Aide-mémoire

Afin de faciliter votre tâche, un aide-mémoire vous est fourni. Passez en revue chaque point lorsque vous réviserez votre travail, vous vous assurerez une page de qualité !

Aide mémoire de l'éditeurVoici un résumé condensé des conventions et de la ligne éditoriale. Pour un exemple de page au standard, voir pré-éclampsie ou STEMI.

La page sera principalement consultée par un professionnel de la santé sur un téléphone intelligent en contexte clinique. Ayez ce besoin en tête lors de la rédaction. La page doit être d'emblée utile en clinique.
L'introduction de la page contient la définition du sujet, elle ne résume pas l'ensemble de la page. Elle est conséquemment très courte.
Idéalement, l'information doit se retrouver dans une seule section sur une même page. Évitez de dupliquer l'information sur une même page.
Si la page a été importée d'une source externe, toutes les sources doivent être converties.
Vous devez favoriser l'usage des listes à puce dans les sections qui y sont favorables (ex. Facteurs de risque, Questionnaire, Examen clinique, Examen paraclinique, Diagnostic différentiel, Traitement). Les sections plus académiques (ex. physiopathologie, approche diagnostique, etc.) doivent être sous forme de phrases complètes/paragraphes. Cela devrait faire en sorte qu'environ la moitié du contenu sera en liste à puce et l'autre moitié en format texte.
Chaque liste à puce doit être précédée d'une courte phrase suivie d'un deux-points (voir les conventions).
Les boîtes oranges et bleues décrivent le contenu que doit présenter chaque section. Lisez-les attentivement. Ces boîtes mentionnent également si les sections sont obligatoires ou optionnelles.
La page doit suivre la structure associée à son type.
La page doit contenir des liens.
La page doit contenir une boîte d'information.
La page doit être correctement référencée.
La page doit répondre aux exigences élevées de Wikimedica en terme de respect du droit d'auteur. Le plagiat est interdit.

Si vous avez un doute, posez une question sur la page de discussion associée ou sur le forum.

Commentaires

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Révision linguistique à jour en date du 2021/11/20.