Salmonellose non typhoïdienne
| Maladie | |
| Caractéristiques | |
|---|---|
| Signes | Arthrite septique, Péritonisme, Ostéomyélite vertébrale, Tachycardie , Choc septique, Péristaltisme augmenté, Faible perfusion périphérique, Douleur abdominale diffuse, Hypotension artérielle , Choc hypovolémique, ... [+] |
| Symptômes |
Frissons, Hypotension orthostatique, Arthrite septique, Anorexie , Nausées, Ostéomyélite vertébrale, Lipothymie , Syncope , Douleur abdominale crampiforme, Douleur abdominale aiguë (approche clinique), ... [+] |
| Diagnostic différentiel |
Dengue, Malaria, Colite ischémique, Fièvre typhoïde, Parasitoses intestinales, Gastro-entérites bactériennes, Maladie inflammatoires intestinales, Rectite radique, Gastro-entérite virale |
| Informations | |
| Wikidata ID | Q150839 |
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Salmonella enterica tire son nom de Daniel Elmer Salmon, un bactériologiste américain, qui a isolé pour la première fois la bactérie d'un intestin de porc en 1884.[1] La bactérie Salmonella est une bactérie Gram-négative, mobile, produisant du sulfure d'hydrogène, un microorganisme intracellulaire facultatif labile acide qui provoque généralement des infections tant chez les humains que chez les animaux. Il existe plus de 2500 sérotypes dans le monde, dont seule la minorité est pathogénique. La salmonellose est une infection causée par tous les sérotypes dit non-thyphoïdiens, ce qui exclut les sérotypes typhi, paratyphi A, paratyphi B (tartrate negative) et paratyphi C.
Un animal porteur est le poulet, qui, mangé mal cuit, peut provoquer Salmonella enteritidis, entraînant une diarrhée inflammatoire. La bactérie Salmonella provoque également une infection focale importante chez les patients atteints de maladies immunodéprimées. Dans l'ensemble, il existe plus de 2500 sérovars de Salmonella dans le monde.[2]
Épidémiologie
Dans les pays développés, comme les États-Unis, la forme la plus courante d'infection à Salmonella se présente sous la forme de gastro-entérite et d'entérocolite. Plus d'un million de cas sont présents chaque année aux États-Unis. Elle est rare aux États-Unis et est généralement contractée à l'extérieur du pays, ramenée au pays par des porteurs. Cependant, il s'agit d'une préoccupation mondiale, avec plus de 153 millions de nouvelles infections par an et environ 57 000 décès par an.[3][4] L'incidence de la salmonellose est la plus élevée en Afrique subsaharienne, atteignant jusqu'à 25,8 cas pour 100 000 personnes par an.[4][5] L'incidence et le risque d'infection dans ces zones sont élevés, en particulier dans les pays à revenu faible ou intermédiaire, en raison d'un mauvais assainissement ainsi que de sources d'eau et d'aliments contaminés par des excréments humains infectés.[2]
Étiologies
Salmonella est un groupe de bactéries à Gram négatif appartenant à la famille des Enterobacteriaceae. La taxonomie actuelle divise le genre Salmonella en 2 espèces (Salmonella enterica et Salmonella bongori) avec une approbation en attente pour une troisième espèce (Salmonella subterranea). S. enterica contient les 6 sous-espèces suivantes: sous-espèce Salmonella enterica. Enterica (sous-espèce I), sous-espèce S. enterica. salamae (sous-espèce II), sous-espèce S. enterica. arizonae (sous-espèce IIIa), sous-espèce S. enterica. diarizonae (sous-espèce IIIb), sous-espèce S. enterica. houtenae (sous-espèce IV) et S. enterica sous-espèce. indica (sous-espèce VI) .[1] Chaque sous-espèce de Salmonella contient plusieurs sérotypes. Sous-espèce S. enterica. enterica contient le plus de sérovars et possède les sérovars les plus significatifs pour la pathologie humaine. Certains des sérotypes les plus courants sont les sérotypes de Salmonella enteritidis, typhimurium, newport et javiana. Les sérotypes typhi et paratyphi conduisent à la salmonelle typhoïde provoquant la fièvre typhoïde et la fièvre paratyphoïde, qui se combinent pour former une fièvre entérique. [6] La salmonelle typhoïde est limitée à l'homme. D'autres sérovars de Salmonella enterica mènent à des Salmonella non typhoïdes (NTS), qui peuvent être trouvées dans un large éventail de vertébrés, y compris les humains, certains sérotypes étant limités aux espèces de vertébrés non humains.[2]
Physiopathologie
Le NTS (« Non-Typhoid Salmonella ») provoque généralement une gastro-entérite, tandis que S. typhi provoque une maladie systémique par l'utilisation de facteurs de virulence. Un type de facteur de virulence produit par S. typhi et non par le NTS comprend l'antigène Vi, qui est une capsule de polysaccharide qui empêche la phagocytose et la destruction des cellules immunitaires. Un autre facteur de virulence spécifique aux formes typhoïdes comprend la toxine typhoïde. La toxine typhoïde est produite lorsque la bactérie Salmonella est intracellulaire et sécrétée par les vésicules vers l'espace extracellulaire, ce qui entraîne une réduction des neutrophiles circulants, une léthargie et d'autres complications neurologiques. D'autres facteurs de virulence importants comprennent les flagelles, qui aident à promouvoir la motilité de la bactérie et le système de sécrétion de type III, qui permet le processus d'attachement et d'insertion dans les cellules non phagocytaires humaines. [7] Grâce à l'utilisation de ces facteurs de virulence, la bactérie pénètre dans l'épithélium intestinal par le M cellules avant d'atteindre les cellules lymphoïdes des plaques de Peyer. Après avoir traversé l'épithélium intestinal, Salmonella pénètre dans les macrophages et est disséminée dans tout le système réticulo-endothélial avant de provoquer une infection systémique.[8] [2]
La transmission par voie directe ou indirecte, les selles en étant le principal moyen de contamination et transmission. L'eau et les aliments contaminés, incluant le poulet, sont une source fréquente de salmonellose. La transmission interhumaine est également possible. La période d'incubation est de 6 à 72 heures. Les sérotypes associés avec des infections davantage invasives sont : Dublin, Choleraesuis, and Typhimurium variant ST313 (spécifique au Brésil et à l'Afrique subsaharienne).[4]
Présentation clinique
La présentation classique de la salmonellose est la gastro-entérite, d'une durée allant de 4 à 7 jours. La diarrhée est de type inflammatoire et les hématochésies sont donc fréquentes. Les autres symptômes gastro-intestinaux sont non-spécifiques, pouvant inclure une douleur abdominale crampiforme, de la nausée et des vomissements.
Il n'est pas rare d'avoir une exposition précise ayant amené l'infection, que ce soit l'ingestion d'un aliment contaminé (i.e. poulet) ou encore un contact infectieux. Par moment, la salmonellose se présentera comme une zoonose.
Dans les symptômes systémiques, la fièvre prédomine. Toutefois, environ 8% des patients développeront une bactériémie et/ou un infection focale non-gastro-intestinale, telles que une méningite, une ostéomyélite, une spondylodiscite ou une arthrose septique.
Facteurs de risque
Plusieurs éléments cliniques clés augmentent le risque des patients de développer une infection systémique ou au-delà du système gastro-intestinal.
- Extrêmes d'age : S'explique par un système immunitaire fragilisé ou immature
- anémie falciforme
- VIH
- Néoplasies
- Hémoglobinopathies autres
- Immunodéficiences autres
Questionnaire
- Symptômes gastro-intestinaux (prédominant) : Diarrhée inflammatoire sanglante, douleur abdominale crampiforme diffuse, nausée/vomissement
- Symptômes systémiques : Fièvre/frissons, diminution apports per os, symptômes de déshydratation (orthostatisme, palpitations, lipothymie/syncope)
- Symptômes musculo-squelettiques : douleur axiale (si spondylodiscite), douleur/oedème/rougeur/chaleur/érythème articulaire (si arthrite septique)
- Méningite
Examen clinique
- Examen cardiovasculaire : Évaluation de la volémie par les signes vitaux, tension veineuse centrale, la perfusion périphérique
- Si déshydratation : tachycardie, hypotension artérielle, faible perfusion périphérique
- Examen abdominal : Péristaltisme augmenté, douleur diffuse, absence ou présence péritonisme
- Examen neurologique selon le questionnaire : Nuque souple, Brudzinski, Kernig
- Examen musculo-squelettique selon le questionnaire
Examens paracliniques
- Bilan initial :
- Formule sanguine complète
- Bilan rénal, incluant gaz veineux (avec ou sans lactates selon le statut hémodynamique) et électrolytes complets
- Bilan septique complet (selon clinique et facteurs de risque) : Pour exclure divers diagnostic différentiels et des complications (i.e. bactériémie)
- Inclut typiquement des cultures de selles et des hémocultures (selon la clinique)
- Protéine C Réactive
Approche clinique
- Évaluation de la volémie et du statut hémodynamique du patient
- Exclure signes de sévérité en considérant les facteurs de risque (c.f. ci-haut) : choc, méningisme, arthrite septique/spondylodiscite
- Procéder au diagnostic différentiel
Diagnostic
La pierre angulaire du diagnostic demeure la culture, typiquement la culture de selles (90% des cas). Elle permet le sérotypage et l'obtention d'un antibiogramme. Il existe de plus en plus de tests autres que les cultures, tels que les PCR (« Polmerase-Chain Reactions »)
Culturing organisms continues to be the mainstay of clinical diagnostic testing for nontyphoidal Salmonella infection. Approximately 90% of isolates are obtained from routine stool culture, but isolates can also be obtained from other sites of infection if present, including blood, urine, abscesses, and cerebrospinal fluid. Although culture-independent diagnostic tests are used increasingly by clinical laboratories to diagnose Salmonella infection, isolates are necessary for serotyping and antimicrobial susceptibility testing. Serologic testing to detect infection with Salmonella is not advised.
Most states mandate that Salmonella isolates or clinical material be submitted to the local or state public health laboratory. To understand submission requirements in a particular state, clinical laboratories are advised to review the disease reporting and mandatory isolate submission regulations of that state and to contact their local public health department with any questions. Salmonellosis is a nationally notifiable disease.
L'étalon-or pour le diagnostic de l'infection à Salmonella est la culture au centre de l'infection. Les options de culture comprennent les selles, le sang, l'urine, la bile, le liquide céphalo-rachidien et la moelle osseuse. La culture de selles est utilisée pour le diagnostic de la gastro-entérite à Salmonella et doit être envisagée en cas de diarrhée sévère persistante ou sanglante. La culture des selles est principalement destinée aux NTS en raison des taux élevés de gastro-entérite. Pour la fièvre entérique, la culture du sang, de la moelle osseuse et de la bile est plus diagnostique que la culture des selles en raison de leur faible présence dans les selles. L'acquisition de liquide céphalo-rachidien pour la culture par ponction lombaire est essentielle pour le diagnostic de la méningite à Salmonella. Une identification plus poussée de Salmonella peut se produire par croissance sur des plaques d'agar sélectives telles que des colonies noires sur des plaques Hektoen Agar en raison de la formation de sulfure d'hydrogène. Pour les patients souffrant de fièvre entérique, la culture de la moelle osseuse est plus sensible que l'hémoculture en raison des concentrations plus élevées de bactéries Salmonella dans la moelle osseuse par rapport au sang.[9] Les nouvelles modalités de diagnostic comprennent les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR). La PCR est plus répandue dans les laboratoires de recherche et devient de plus en plus courante en milieu clinique.[2]
Diagnostic différentiel
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| Exemple: | Le diagnostic différentiel de l'appendicite comprend :
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Les infections à Salmonella ressemblent à de nombreuses maladies fébriles. Le diagnostic peut être confondu avec d'autres conditions dans des régions similaires où l'infection à Salmonella est endémique, comme la gastro-entérite aiguë, les infections virales, l'infection par des micro-organismes intracellulaires et d'autres infections bactériennes. Le diagnostic différentiel comprend le paludisme, la tuberculose, la brucellose, la tularémie, la leptospirose, l'encéphalite, l'endocardite, la grippe, la dengue, la mononucléose infectieuse et la leishmaniose viscérale. Les antécédents de voyage sont importants pour envisager la fièvre typhoïde, car l'infection est un phénomène courant en dehors des États-Unis.[10] [2]
Traitement
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Dans la plupart des cas, le traitement doit être axé sur la correction de la déshydratation et des troubles électrolytiques. Des soins de soutien sont nécessaires en cas de diarrhée aiguë et de symptômes de déshydratation. Un traitement antipyrétique peut également être fourni si nécessaire. Le NTS non compliqué localisé dans une gastro-entérite sans symptômes de septicémie n'est pas traité avec des antibiotiques, à l'exception des patients de moins de 3 mois et des patients présentant des états immunodéprimés. Une fois la gastro-entérite NTS identifiée, des hémocultures doivent être effectuées. Dans le cadre d'une bactériémie NTS ou d'une maladie disséminée, le traitement initial doit être avec des céphalosporines de troisième génération comme la ceftriaxone pendant au moins 7 à 10 jours. Une fois les susceptibilités bactériennes connues, le traitement antibiotique peut passer à l'azithromycine ou à une fluoroquinolone. La durée du traitement peut être prolongée dans certaines infections focales telles que la méningite (4 semaines) ou l'ostéomyélite (4 à 6 semaines) .[2]
Pour la fièvre entérique, le traitement antibiotique de choix est une fluoroquinolone. Cependant, la fièvre entérique multirésistante est de plus en plus courante dans le monde, ce qui conduit à une plus grande concentration sur les tests de sensibilité et l'utilisation d'antibiotiques alternatifs tels que les céphalosporines de troisième génération et l'azithromycine. Les fluoroquinolones ne sont pas utilisées chez les enfants aussi souvent que chez les adultes, et des alternatives comme l'azithromycine sont souvent préférées. La durée du traitement est généralement de 10 à 14 jours. En cas de fièvre entérique sévère accompagnée de symptômes de délire, d'étouffement, de stupeur ou de choc, un traitement supplémentaire par corticostéroïdes peut être envisagé. Il a été démontré que la dexaméthasone à 3 mg / kg, suivie de 1 mg / kg toutes les 6 heures pendant 48 heures, diminue la mortalité. Les porteurs chroniques de la bactérie nécessitent quatre semaines de traitement par fluoroquinolone pour résoudre le statut de porteur. Chez l'adulte, en cas d'échec du traitement antimicrobien, une cholécystectomie peut être envisagée en raison de la persistance de la bactérie dans la vésicule biliaire. [9][10][2]
Suivi
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Complications
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| Exemple: | Les complications de l'infarctus du myocarde sont :
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Les patients atteints de gastro-entérite NTS peuvent présenter une déshydratation s'ils ne sont pas correctement traités. Les complications ont tendance à exister lorsqu'elles sont associées à d'autres maladies. Les patients atteints de maladies immunodéprimées peuvent présenter une infection systémique impliquant plusieurs organes entraînant une septicémie, un choc et la mort. [2]
La fièvre typhoïde peut s'accompagner de complications neurologiques telles que le délire, la psychose, l'ataxie cérébelleuse aiguë et le syndrome de Guillain-Barré. Les complications cardiovasculaires de la fièvre typhoïde comprennent la myocardite et la péricardite. Les complications gastro-intestinales comprennent l'hémorragie intestinale et la perforation. La fièvre entérique peut conduire à des porteurs chroniques si elle ne répond pas au traitement ou si elle est traitée de manière inappropriée.[2]
Évolution
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| Description: | Cette section contient le pronostic et évolution naturelle de la maladie. Le pronostic est lié à la survie du patient atteint de la maladie. L'évolution naturelle est la manière dont évoluera la maladie du patient dans le temps. |
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| Exemple: | La dissection aortique est associée une mortalité très élevée. Au moins 30% des patients décèdent après leur arrivée à l'urgence, et ce, même après une intervention chirurgicale. Pour ceux qui survivent à la chirurgie, la morbidité est également très élevée et la qualité de vie est mauvaise. La mortalité la plus élevée d'une dissection aortique aiguë est dans les 10 premiers jours. Les patients qui ont une dissection chronique ont tendance à avoir un meilleur pronostic, mais leur espérance de vie est raccourcie par rapport à la population générale.[1] Sans traitement, la mortalité est de 1 à 3% par heure au cours des 24 premières heures, 30% à une semaine, 80% à deux semaines et 90% à un an. |
La plupart des personnes infectées par le NTS se rétablissent complètement sans autre séquelle. Cependant, les patients malnutris avec des soins de soutien insuffisants peuvent développer une diarrhée prolongée, une déshydratation et d'autres complications. Les personnes nécessitant un traitement antibiotique (nourrissons et patients présentant des états immunodéprimés) peuvent avoir une évolution prolongée de la maladie avec une gravité accrue de la maladie et souvent une atteinte systémique. Pour la fièvre entérique, les patients ont tendance à se rétablir complètement s'ils sont rapidement diagnostiqués et traités de manière appropriée. Si le diagnostic est retardé et que les antibiotiques et les dosages appropriés ne sont pas utilisés, des résultats indésirables ont tendance à se produire. Les patients malnutris infectés par des souches multirésistantes ont tendance à avoir plus de complications. Les porteurs chroniques surviennent lorsque les patients ne répondent pas à l'antibiothérapie et excrètent la bactérie pendant plus de trois mois. Les porteurs chroniques sont rares chez les enfants mais ont tendance à augmenter en âge et chez les patients atteints d'une maladie de la vésicule biliaire. Les patients peuvent devenir des porteurs urinaires chroniques lorsqu'ils sont co-infectés par la schistosomiase.[2]
Prévention
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| Description: | Cette section traite des mesures préventives et du dépistage précoce de la maladie (lorsque pertinent). |
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| Exemple: | La prévention primaire consiste à la prise en charge des facteurs de risque :
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La prévention de l'infection à Salmonella se concentre sur plusieurs catégories, notamment l'assainissement, la garde d'enfants avec des animaux domestiques et la vaccination. La prévention de l'infection à Salmonella grâce à de bonnes pratiques d'assainissement implique un approvisionnement en eau propre et des pratiques appropriées de manipulation des aliments. La contamination des approvisionnements en eau peut favoriser l'infection à Salmonella, et la chloration avec purification de l'eau est essentielle pour prévenir l'infection. Les aliments doivent être traités correctement dans les cuisines. Les manipulateurs d'aliments doivent appliquer de bons protocoles de lavage des mains. Les aliments de rue comme les fruits et la crème glacée ainsi que les produits d'origine animale comme les œufs crus, le poulet et la viande non cuite sont d'importantes sources d'infection. [2]
Les animaux domestiques et les soins aux enfants sont une source importante d'infection à Salmonella. Les reptiles et les amphibiens sont une source connue de transmission de Salmonella aux humains. Après avoir manipulé ces animaux, les individus doivent se laver les mains. Il ne doit y avoir ni nourriture ni boisson dans les zones où les animaux sont manipulés. Ces animaux ne devraient pas être trouvés dans les garderies ou devraient être inaccessibles aux enfants de moins de cinq ans. Les patients présentant des états immunodéprimés ne doivent pas manipuler des reptiles et des amphibiens. Les enfants infectés par Salmonella peuvent retourner à l'école et à la garderie une fois que les symptômes comme la diarrhée ont disparu. Dans Salmonella typhi ou paratyphi 3, les cultures de selles négatives doivent être documentées avant que l'enfant ne soit autorisé à retourner à l'école. [2]
La vaccination est une méthode courante pour prévenir la fièvre typhoïde. Deux vaccins offrent une protection contre Salmonella serovar typhi. Ils sont recommandés aux voyageurs, aux personnes ayant une exposition intime aux porteurs de la fièvre typhoïde et aux travailleurs de laboratoire exposés à Salmonella. Le premier vaccin, le vaccin contre la typhoïde de souche Ty21a, est un vaccin oral vivant atténué administré à des patients de six ans et plus. Le vaccin est administré en 4 doses les jours 0, 2, 4 et 6. La vaccination doit être terminée une semaine avant l'exposition. Les rappels, avec les 4 doses orales, doivent être complétés tous les 5 ans. Les antimicrobiens comme le proguanil, la méfloquine, la chloroquine et d'autres antibiotiques ne doivent pas être administrés au moins 3 jours avant le début de la vaccination et au moins 3 jours après la fin de la vaccination selon le médicament. Le deuxième vaccin est un vaccin polysaccharidique capsulaire Vi (ViCPS) administré aux patients de 2 ans et plus. Il est administré en une injection intramusculaire unique au moins 2 semaines avant l'exposition. Les boosters sont administrés tous les 2 ans. [11][12] [2]
Références
- Cette page a été modifiée ou créée le 2020/11/11 à partir de Salmonella (StatPearls / Salmonella (2020/08/10)), écrite par les contributeurs de StatPearls et partagée sous la licence CC-BY 4.0 international (jusqu'au 2022-12-08). Le contenu original est disponible à https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32310352 (livre).
- ↑ 1,0 et 1,1 Lin-Hui Su et Cheng-Hsun Chiu, « Salmonella: clinical importance and evolution of nomenclature », Chang Gung Medical Journal, vol. 30, no 3, , p. 210–219 (ISSN 2072-0939, PMID 17760271, lire en ligne)
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- ↑ John P. Dekker et Karen M. Frank, « Salmonella, Shigella, and yersinia », Clinics in Laboratory Medicine, vol. 35, no 2, , p. 225–246 (ISSN 1557-9832, PMID 26004640, Central PMCID 4443274, DOI 10.1016/j.cll.2015.02.002, lire en ligne)
- ↑ 4,0 4,1 et 4,2 (en) « Salmonellosis (Nontyphoidal) », sur https://wwwnc.cdc.gov/travel/yellowbook/2020/travel-related-infectious-diseases (consulté le 24 juin 2021)
- ↑ John A. Crump, Maria Sjölund-Karlsson, Melita A. Gordon et Christopher M. Parry, « Epidemiology, Clinical Presentation, Laboratory Diagnosis, Antimicrobial Resistance, and Antimicrobial Management of Invasive Salmonella Infections », Clinical Microbiology Reviews, vol. 28, no 4, , p. 901–937 (ISSN 1098-6618, PMID 26180063, Central PMCID 4503790, DOI 10.1128/CMR.00002-15, lire en ligne)
- ↑ A. Andino et I. Hanning, « Salmonella enterica: survival, colonization, and virulence differences among serovars », TheScientificWorldJournal, vol. 2015, , p. 520179 (ISSN 1537-744X, PMID 25664339, Central PMCID 4310208, DOI 10.1155/2015/520179, lire en ligne)
- ↑ Rebecca Johnson, Elli Mylona et Gad Frankel, « Typhoidal Salmonella: Distinctive virulence factors and pathogenesis », Cellular Microbiology, vol. 20, no 9, , e12939 (ISSN 1462-5822, PMID 30030897, DOI 10.1111/cmi.12939, lire en ligne)
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