Gestion:Ontologie

De Wikimedica
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Attention ! Cette ontologie est encore à l'état expérimental et peut donc être appelée à changer.

Une ontologie est un ensemble structuré des termes, concepts et attributs permettant la représentation d'un domaine de connaissances. L'ontologie de Wikimedica dicte une manière d'organiser les pages de manière à ce que l'information puisse non seulement être aisément consultée et organisée par les utilisateurs, mais aussi par des programmes informatiques.

1 Concept[modifier | w]

Dans Wikimedica, toutes les pages contenant de la connaissance (signes, maladies, traitements, etc.) sont décrites comme des concepts. Un concept est organisé de manière précise et les classes qui en dépendent répondent elles-aussi de cette organisation. Cette manière de faire permet la définition d'une interface commune entre toutes les classes de l'ontologie.

1.1 Structure[modifier | w]

Un concept est défini comme une structure minimalement dotée des attributs suivants:

Concept
PositionNomObligatoireDescriptionCommentairesExempleBalises sémantiquesFormats
1DéfinitionvraiCette section contient la définition du concept et devrait se résumer à quelques phrases au maximum : il ne s'agit pas d'une introduction. S'il existe des pages alternatives ou des nuances qui seraient susceptibles d'intéresser le lecteur, elles seront mentionnées dans cette section avec des liens. Le format attendu est le texte.Une erreur fréquente est de mettre des signes, des symptômes et le traitement dans l'introduction. Dans un soucis de concision, et considérant que votre page sera consultée autant sur ordinateur que sur les téléphones intelligents, la définition sert à définir à la manière d'un dictionnaire.L'appendicite est l'inflammation et l'infection de l'appendice.
99NotesfauxDans la section notes se trouve toutes les notes de bas de page (références du groupe "note" [ou autres]).Pour ajouter des notes, passez par la fonction d'ajout de notes. Il est aussi possible d'ajouter des notes d'autres groupes, comme "pharmaco", "pédiatrie", "indications", etc. Classez ces autres groupes de notes dans des sous-sections. N'ajoutez pas de notes manuellement.TRAITEMENTS

Les traitements:

  • médicament 1, 100-200 mg PO DIE[pédiatrie]
  • traitement 2 BID x 1 sem[gériatrie]

NOTES


Gériatrie

  1. Poursuivre le traitement 2 semaines de plus.

Pédiatrie

  1. 10mg/kg die
999RéférencesvraiDans la section références se trouve toutes les références (références sans groupe). Pour ajouter des références, passez par la fonction d'ajout de références. N'ajoutez pas de références manuellement.

Dans cette structure, seul l'introduction est obligatoire. Elle doit résumer le contenu de la page de manière à ce qu'un lecteur puisse se faire une idée claire du concept traité par la page sans avoir à lire tout ce qui est écrit.

Les autres classes de l'ontologie, définies plus bas, iront ajouter des attributs à cette structure de pages afin de préciser leurs propriétés et fonctionnalités.

1.2 Propriétés[modifier | w]

Concept

Un concept possède de nombreuses propriétés, comme une image, un vidéo, un son, une traduction anglaise, etc. À ces propriétés de base, les autres classes de l'ontologie rajouteront leur propres propriétés. Les propriétés sont des données sémantiques permettant à des programmes informatiques de naviguer Wikimedica et aux humains d'opérer des requêtes complexes sur son contenu. Elle sont définies à la fois dans la structure du concept, mais aussi automatiquement par l'entremise des différents modèles qu'il utilise.

2 Classes[modifier | w]

La classe principale de laquelle héritent toutes les autres classes est le Concept (catégorie, prototype, infobox) Un concept est un élément de connaissance. Dans Wikimedica, toutes les pages contenant de l'information (cours, thèmes, sous-thèmes, maladies, traitements, etc.) sont décrites comme des concepts et reprennent donc et précisent ses propriétés.

Concept (catégorie, prototype, infobox) Un concept est un élément de connaissance. Dans Wikimedica, toutes les pages contenant de l'information (cours, thèmes, sous-thèmes, maladies, traitements, etc.) sont décrites comme des concepts et reprennent donc et précisent ses propriétés.
    • Maladie (catégorie, prototype, infobox) Une maladie est une altération des fonctions ou de la santé.
    • Classe de maladie (catégorie, prototype, infobox) Une classe de maladie regroupe plusieurs maladies aux présentations ou étiologies similaires.
    • Approche clinique (catégorie, prototype, infobox) L'approche clinique est une situation auquel un professionnel de la santé peut être exposé lors de sa pratique et qui demande une prise en charge.
    • Symptôme (catégorie, prototype, infobox) Un symptôme est une donnée subjective de la part du patient indiquant la présence ou l'absence d'une maladie. Un symptôme, contrairement au signe, peut n'être décelable qu'au questionnaire du patient.
    • Signes
        • Signe clinique (catégorie, prototype, infobox) Une signe clinique est une donnée objective pouvant être démontrée par l'examen physique indiquant la présence ou l'absence probable d'une maladie.
        • Signe paraclinique (catégorie, prototype, infobox) Une signe paraclinique est une donnée objective pouvant être démontrée par un examen paraclinique indiquant la présence ou l'absence probable d'une maladie.
    • Examen paraclinique (catégorie, prototype, infobox) Un examen paraclinique mets en oeuvre des technologies d'imagerie ou de laboratoire afin d'aider le clinicien dans son diagnostic.
    • Questionnaire (catégorie, prototype, infobox) Le questionnaire permet au clinicien d'explorer verbalement lors de l'entrevue un aspect de l'histoire de la maladie actuelle. Le questionnaire permettra généralement de mettre en évidence des signes cliniques ou des symptômes.
    • Facteur de risque (catégorie, prototype, infobox) Un facteur de risque est tout attribut, caractéristique ou exposition d’un sujet qui augmente la probabilité de développer une maladie.
    • Examen clinique (catégorie, prototype, infobox) Un examen clinique permet au clinicien d'objectiver la présence de signes cliniques.
    • Spécialité (catégorie, prototype, infobox) Une spécialité est un champ de connaissances du domaine la santé (example: Soins infirmiers, Pharmacie, Hématologie, Médecine familiale).
    • Outil clinique (catégorie, infobox) Un outil clinique vise à aider le clinicien dans son travail.
        • Règle de décision clinique (catégorie, prototype, infobox) Une règle de décision clinique est une liste de critères permettant au clinicien de se faire un idée sur la probabilité de la présence ou de l'absence d'une maladie (exemple: Score de Wells).
        • Outil d'aide à la décision partagée (catégorie, prototype, infobox) Un outil d'aide à la décision partagée permet de faciliter le processus par lequel le patient et le clinicien en viennent à prendre une décision médicale
        • Critères diagnostiques (catégorie, prototype, infobox) Cette classe permet de lister des critères diagnostiques.
        • Classification clinique (catégorie, prototype, infobox) Une classification clinique permet la quantification de l'état ou de la progression d'une Maladie (exemple: Classe NYHA).
        • Protocole (catégorie, prototype, infobox) Un protocole est une manière standardisée de prendre en charge une situation (situation clinique, maladie, etc.)
        • Algorithme Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
    • Traitement (catégorie, prototype, infobox) Un traitement est un geste, une intervention ou un médicament présentant des propriétés curatives ou préventives à l'égard des maladies humaines.
        • Procédure (catégorie, prototype, infobox) Une procédure est un geste ou une intervention faite dans une visée d'investigation, curative ou préventive à l'égard des maladies humaines. Par exemple, une biopsie de moelle osseuse, une cure d'hernie ombilicale avec mèche, une extraction de dents de sagesses.
        • Exercice (catégorie, prototype, infobox) Un exercice est une manoeuvre physique faite par le patient lui-même (avec ou sans supervision) ayant un but curatif ou palliatif d'une maladie.
        • Programme d'exercices (catégorie, prototype, infobox) Un programme d'exercices est un groupe d'exercices faite par le patient lui-même (avec ou sans supervision) ayant un but curatif ou palliatif d'une maladie.
        • Traitement pharmacologique Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
            • Médicament (catégorie, prototype, infobox) Un médicament est toute substance ou composition présentée comme possédant des propriétés curatives ou préventives à l'égard des maladies humaines.
            • Classe de médicament (catégorie, prototype, infobox) Une classe de médicament regroupe des médicaments aux propriétés chimiques, physiologiques ou indications semblables.
    • Pathogène (catégorie, prototype, infobox) Un pathogène est un agent biologique, chimique, physique pouvant causer une maladie. Ces agents peuvent être exogènes ou endogènes (métabolites, protéines, etc.)
    • Pages pour les patients
        • Concept (patient) (catégorie, prototype, infobox) Un concept est un élément de connaissance. Cette classe est la version patient de Classe::Concept.
        • Maladie (patient) (catégorie, prototype, infobox) Une maladie est une altération des fonctions ou de la santé. Ce type de page est spécifiquement fait pour les patients.
        • Procédure (patient) (catégorie, prototype, infobox) Une procédure est un geste ou une intervention faite dans une visée d'investigation, curative ou préventive à l'égard des maladies humaines. Par exemple, la biopsie de moelle osseuse, la cure d'hernie ombilicale avec mèche et une extraction de dents de sagesses sont des procédures.
        • Approche clinique (patient) (catégorie, prototype, infobox) L'approche clinique est une situation auquel un professionnel de la santé peut être exposé lors de sa pratique et qui demande une prise en charge. La version pour patient présente l'information vulgarisée pour les patients.
    • Principe anatomique (catégorie, prototype, infobox) Un principe anatomique est un concept relié à l'anatomie du corps humain.
        • Repère Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
        • Mouvement Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
        • Région anatomique (catégorie, prototype, infobox) Une région anatomique est un regroupement de diverses entités anatomiques.
        • Entité anatomique (catégorie, prototype, infobox) Une entité anatomique est une partie physique de l'anatomie du corps humain (exemples: coude, coeur, vésicule biliaire, aorte.
            • Tissu (catégorie, prototype, infobox) Le tissu est un niveau d'organisation cellulaire entre la cellule et un organe complet (exemple: sang, pulpe blanche, tendon).
            • Muscle (catégorie, prototype, infobox) Un muscle est un organe du corps humain permettant son mouvement et son maintient.
            • Organe Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
            • Vaisseaux
                • Artère (catégorie, prototype, infobox) Une artère est un vaisseau principal dont le rôle est d'amener le sang depuis le coeur vers un tissu.
                • Veine Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
                • Lymphatique Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
            • Os (catégorie, prototype, infobox) Un os est une structure minéralisée du corps humain permettant son soutien.
            • Articulation (catégorie, prototype, infobox)
            • Ligament (catégorie, prototype, infobox) Un ligament est un faisceau de tissu fibreux blanchâtre, très résistant, unissant les éléments (cartilages, os) d'une articulation.
            • Nerf Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.
            • Cellule (catégorie, prototype, infobox) La cellule est le constituant vivant de la plupart des structures du corps humain (exemple: mélanocyte, cardiomyocyte, lipocyte).
        • Système Cette classe est planifiée, mais n'a pas encore été créée.


2.1 Classes désuètes[modifier | w]

2.2 Versionnage des classes[modifier | w]

Les classes ontologiques sont versionnées, cela permet d'effectuer une transition continue de la structure des pages sans avoir à invalider toutes les pages d'une classe lorsque cette dernière change. La version de la classe d'une page est définie dans le modèle d'information (paramètre version_de_classe) et la version d'une classe est indiquée dans sa page de définition dans Modèle:Classe ontologique.

La version d'une classe est augmentée dans les conditions suivantes:

  1. les sections obligatoires ou facultatives ont été modifiées
  2. le sens d'une section ontologique a été modifié
  3. les données sémantiques que les sections obligatoires ou facultatives ont été modifiées
  4. tout autre changement qui devrait avoir une répercussion sur toutes les pages d'une classe.

La version d'une classe n'a pas besoin d'être augmentée lorsque des changements sont apportés aux commentaires, exemples ou descriptifs (qui ne changent pas le sens).

3 Tâches[modifier | w]

Créer une nouvelle tâche
À faire 2 / 8
En cours 5 / 7
En test 1 / 8
Terminées 13 / 21
- Type Priorité Titre Responsable(s) État Création
350 Amélioration Urgente Modificateurs de signes, symptômes et facteurs de risques Jppialasse, Antoine Mercier-Linteau, Michaël St-Gelais En test 15 mai 2020
383 Tâche Urgente Définition sémantique des traitements Antoine Mercier-Linteau, Michaël St-Gelais En cours 25 août 2020
562 Tâche Urgente Pages de symptômes sur les différentes douleurs Antoine Mercier-Linteau En cours 20 mars 2022
36 Amélioration Normale Propriétés sémantiques pour la section épidémiologie À faire 13 décembre 2017
367 Tâche Normale Déterminer la structure ontologique de l'analyse d'un article scientifique (lecture critique) Jppialasse, Antoine Mercier-Linteau À faire 3 juillet 2020
528 Tâche Normale Réviser et déterminer la structure ontologique des procédures Michaël St-Gelais, Olivier Mailloux, Hélène Milot En cours 22 juillet 2020
474 Tâche Normale Signes et symptômes musculosquelettiques Antoine Mercier-Linteau, Michaël St-Gelais En cours 20 juillet 2021
482 Tâche Normale Analyser la structure des articles du Manuel de nutrition clinique Antoine Mercier-Linteau, Michaël St-Gelais, Ann-Marie Paradis En cours 31 août 2021
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